На Наруто возложена миссия заполучить шпиона бывшего члена Акацуки - Мукадэ пропавшего без вести. Наруто отправляется к руинам долины Оурен и находит там Мукаде. Цель Мукаде найти спящий Луч света, Мукада пытается воспользоваться этой силой и по не осторожности мощный луч света охватывает Наруто и отправляет его в прошлое, за 20 лет до его рождения. После того, как он проснётся, он встречает четвертого Хокаге - Минато Намикадзе! Своего родного отца.

С незапамятных времен Земля была покрыта лесами, в которых с незапамятных времен обитали духи Богов. В те далекие времена люди и звери жили вместе, в гармонии, но со временем большая часть лесов была уничтожена. Оставшиеся леса охраняли огромные звери, давшие клятву верности великому Духу Леса. То были времена Богов и Демонов. Принц Ашитака заметил в лесу что-то странное, но это был не человек, а демон, вепрь весь покрытый клубящимися червями. Тот, до кого он дотронется ждет страшное проклятие. Ашитака поскакал предупредить жителей деревни, умоляя демона остановиться, но потом выстрелил из лука и попал чудищу прямов глаз. Демон был убит, но успел дотронуться до Ашитаки. Умирая Демон в образе вепря обещал, что люди будут страдать также, как страдал и он. Старая знахарка рассмотрела рану и предсказала Ашитаке, что только он сам может изменить свою судьбу и для этого ему надо отправиться на Запад, где царствует зло. Он должен пойти туда и увидеть то, что сможет увидеть взглядом, не затуманенным ненавистью. Там он сможет найти способ избавиться от проклятия. И Ашитака тронулся в путь. Через какое-то время он прибыл в таинственную страну, где люди, возглавляемые злой госпожой, воевали с обитателями леса: духами, демонами и гигантскими существами. И там он встретился с принцессой Мононоке, повелительницей зверей и дочерью волчицы. И теперь судьба всех зависит только от отважного принца Ашитаки...

Будущее, возможно Япония. Долгое время люди в практическом применении использовали роботов, и вот настала новая ступень эволюции и на сцену взошли андроиды по внешности не чем не уступающие человеку.
Под влиянием Комитета по Этике Роботов (или Робото-Этический Комитет)(КЭР) это стало обыденностью для людей, использовать их как "бытовую технику". Чтобы было различие между человеком и андроидом у каждого из них над головой находится (голографическое) кольцо, это привело к некоторому сочувствию людей к андроидам и такому знаку отличия. Такие люди получили известность как "андроидо-холики", и стали социальной проблемой общества.
Рикуо, студент средней школы, и с детства приучен, что андроидов не должны рассматривать как людей, и их удел быть инструментами облегчающий жизнь человека. Однажды Рикуо обнаруживает некоторые странные данные в электронных отчетах андроида своей семьи, Самми.
Рикуо и его друг Масаки решают проследить за андроидом, и в итоге обнаруживают таинственное кафе, в котором есть одно главное правило - "люди и роботы здесь одинаковы".